El Palacio cuenta con dos auditorios de gran capacidad, el María de Maeztu -en honor a la pedagoga vitoriana, autora entre otras obras de la "Historia de la cultura europea"- y el Francisco de Vitoria, por el humanista del siglo XV.
Los dos auditorios están acondicionados con un moderno equipamiento audiovisual, cámaras de grabación, pantallas de grandes dimensiones, Internet y cabinas de traducción simultánea.
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